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Assemblage et Trafic de Ribonucléoprotéines

Remy Bordonne

Projets de recherche

Les travaux de l’équipe portent sur l'étude des relations fonctionnelles entre la biogenèse de ribonucléoprotéines, la formation d'un complexe SMN et l'atrophie spinale musculaire. Nous étudions la fonction de SMN dans l'assemblage et le transport de différentes RNPs et caractérisons les anomalies moléculaires associées à une carence en protéine SMN.

Nos objectifs spécifiques sont les suivants:

1.Nous avons montré que les mutations SMN génèrent des défauts dans la formation de la tri-snRNP du spliceosome mineur, donnant lieu à des défauts d'épissage des introns mineurs de U12.

Nous proposons maintenant de mieux caractériser les altérations d'épissage de gènes portant des introns mineurs dans des modèles SMA. Outre la révélation des processus défectueux lors de mutations SMN, ces études devraient également permettre la caractérisation d'éléments structuraux communs aux introns mal épissés.

2.Par l'utilisation de cellules souches portant un gène SMN sauvage ou muté, nous proposons de valider et d'étudier les interactions entre le complexe SMN et certains ARN messagers d'axones, que nous avons montré être associés à la protéine SMN dans des expériences d'immuno-précipitation.

Nous allons plus précisément établir que ces interactions se produisent effectivement dans les axones en utilisant le système des chambres microfluidiques et essayer de caractériser les éléments structurels des ARNm requis pour le transport par le complexe SMN.

3.Nous avons montré que les cellules de S. pombe portant un  allèle temperature-degron de SMN (tdSMN) reproduisent les défauts d'assemblage des snRNPs et d'épissage observés dans les cellules de métazoaires portant des mutations SMN.

À l'aide de méthodes classiques de génétique de la levure, nous proposons de trouver des gènes suppresseurs capables de complémenter le défaut de croissance de la souche tdSMN. Nous proposons également d'étudier leurs relations fonctionnelles avec la protéine SMN chez les métazoaires.

Membres

Team leader

Remy BORDONNE

Chercheur DR2

(+33) 04 34 35 96 47

111

Marie ANTOINE

IE-Recherche

+33 (0)4 34 35 96 46

Pauline DUC

Doctorant

+33 (0)4 34 35 96 46

111

Florence RAGE

CRCN

(+33) 04 34 35 96 47

111

Fatimat SHIDI

IE-Recherche

+33 (0)4 34 35 96 47

111

Johann SORET

Chercheur DR2

(+33) 04 34 35 96 47

111

Hadrien TROUQUET

Stagiaire

+33 (0)4 34 35 96 47

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Sélection de publications

Toutes les équipe de recherche

Mots-clés
Model organism studied
Cells derived from SMA patients, NSC34 motorneuron-like cells, S. pombe
Biological process
snRNP biogenesis, RNA transport
Biological techniques
Molecular and cellular biology, FISH, yeast genetics