Les facteurs de transcription (TF) agissent de manière combinatoire, par compétition ou collaboration, pour réguler leurs gènes cibles. Plusieurs questions demeurent au sujet de la conservation de ces combinatoires pour différentes classes de gènes, séquences régulatrices et types cellulaires. Nous proposons ici une nouvelle approche d’apprentissage automatique capable d’inférer ces combinatoires de TFs. Cette approche démontre que les combinatoires de TFs sont conservées entre les différentes classes de gènes (mRNA, miRNA et lncRNA) dans différents types cellulaires mais diffèrent en fonction des séquences régulatrices (enhancers et promoters).
Apprentissage automatique pour sonder les combinatoires de facteurs de transcription
6 février 2019